FTPクライアントソフトの定番、FFFTPですが、FFFTPのバージョンによってはファイルをサーバにアップロードするときに1、2秒ほどアップロードされずに固まった状態になってしまうことがあります。ファイルをアップロードするときにスムーズなアップロードではなく、引っかかる感じになります。
この引っかかりが気になるようであれば、思い切ってFTPクライアントソフトを変えてしまいましょう。私もFFFTPの引っかかりが気になっていましたので変更しました。使用しているソフトは、WinSCPです。
このソフトを使用してからは、ストレスなく、ファイルアップロードができるようになりました！